尽管我国保健品产业已有快速发展，但有诸多问题严重制约保健品行业的进一步健康发展。
一是低水平重复生产现象严重，不利于竞争力的提升。据统计，我国共有保健品企业3000多家，其中，投资总额在1亿元以上的大型企业只占总数的1.45%，投资总额在5000万元至1亿元的中型企业占38%，100万元以下10万元以上的小型企业占了41.39%；投资不足10万元的作坊式企业占12，5%。
内容选自中国产业研究报告网发布的《保健品发展面临的问题》http://www.chinairr.org/view/V08/201306/09-135656.html
二是过份依赖广告促销，不利于提高质量水平。有些企业的广告费高达销售额的30%以上，从一开始就陷入研发低投入、广告高投入的怪圈。在广告宣传中，又较多地存在夸大宣传现象，惯于使用“概念炒作”，把它作为保健品“造市”法宝，实际上成为保健品“短命”的硬伤，这使得保健品产业常常陷入了“概念——市场——概念”的经营误区。
三是产品开发力量薄弱，不利于提高科技含量。目前，不少专业保健品企业技术力量薄弱，产品开发投入少，且带有很大的盲目性，较多采用买断经销权或外购产品的办法，使得整个保健品产业的产品层次很低。
四是难以面对国外企业进入，不利于提高市场份额。目前有20多家国际知名保健品跨国公司通过收购、兼并、租赁等形式，在中国设立分厂，斥巨资进驻我国市场。
五是产业法规不完善，不利于提高政府监管能力。目前保健品产业还没有统一的行政归口管理部门，卫生、医药、工商等部门各自为政，还没有制定一个可操作性的产业标准以及规范统一的检测手段、审查程序和管理办法。一些违法经营者便采取打“擦边球”的策略进入保健品市场，一些不具备生产条件的厂家，在该产业较高利润的刺激下，纷纷投产或转产保健品，这是导致假冒伪劣产品泛滥的一个重要原因。
由于以上问题的存在，我国的保健品产刚刚起步就面临着严重的现实和潜在危机，成了“问题产业”，往往使消费者难以实现“花钱买健康”的目的。保健品企业很快得到了市场的“负回报”。
进一步发展保健品产业的策略
在未来5到10年或更长一些的时间里，保健品产业必须进行产业整顿，使之步入健康有序的发展轨道，力争实现一种竞争有序的产业格局，以优质的产品恢复消费者对国内保健品的信任度，并积极进入海外市场。
